La Dra. Andrea Silva es Bióloga Evolutiva con investigaciones en los campos de la genética, la genómica y biología molecular. Se desempeña como directora de Investigación y Proyectos en AUSTRAL-omics, Core-Facility dependiente de la VIDCA-UACh. Además, es parte del Instituto de Ciencias Ambientales y Evolutivas de la UACh. Su interés científico se centra en la genómica funcional y evolución, buscando comprender los mecanismos moleculares involucrados en las respuestas fisiológicas de los organismos frente a variables ambientales.
En este taller conversaremos sobre cómo redireccionar un experimento de HTS de muestras mixtas para poder resolver preguntas propias que surgen de dichos diseños: ¿Cuál es el esfuerzo de secuenciación requerido?, ¿Cuál es el tamaño de lectura adecuado?, ¿Necesitas secuenciación de ampliaciones, shotgun sequencing o de RNA? ¿La secuenciación debe ser Single Read o Paired End? ¿Usamos ASV u OTUS en la asignación taxonómica?, ¿Depletamos ribosomal o enriquecemos en mRNA? Abordaremos estas y otras interrogantes, y cómo resolverlas, revisando algunos casos de estudio en los que he participado como investigadora o en años de asesoría en el laboratorio AUSTRAL-omics.