Cursos
Conformación de colecciones de cultivos microbianos
Contenidos: Organización de una colección; Preservación ex situ de microorganismos por criopreservación y liofilización; Distribución de microorganismos.
Determinación de parámetros morfológicos de hojas, raíces y semillas, a través del análisis de imágenes
Contenidos: Introducción a los análisis morfológicos en base a imágenes; Sistemas de captación de imágenes; Softwares abiertos y de pago para determinación de parámetros morfológicos.
Recolección de semillas de especies silvestres con fines de conservación y restauración
Contenidos: Aspectos generales de la recolección de semillas; Planificación de una campaña de recolección de semillas; Identificación de especies y técnicas de recolección de semillas.
Identificación molecular de microorganismos mediante multilocus
Contenidos: Extracción de ADN y secuenciación de múltiples genes; Alineamiento, concatenación y realización de árboles filogenéticos; Creación de bases de datos de secuencias.
Metabarcoding, metagenómica y metatranscriptómica: ¿Cuándo, cómo y por qué?
En este taller conversaremos sobre cómo redireccionar un experimento de HTS de muestras mixtas para poder resolver preguntas propias que surgen de dichos diseños: ¿Cuál es el esfuerzo de secuenciación requerido?, ¿Cuál es el tamaño de lectura adecuado?, ¿Necesitas secuenciación de ampliaciones, shotgun sequencing o de RNA? ¿La secuenciación debe ser Single Read o Paired End? ¿Usamos ASV u OTUS en la asignación taxonómica?, ¿Depletamos ribosomal o enriquecemos en mRNA? Abordaremos estas y otras interrogantes, y cómo resolverlas, revisando algunos casos de estudio en los que he participado como investigadora o en años de asesoría en el laboratorio AUSTRAL-omics.
Análisis Bioinformático de Metabarcoding: explorando la diversidad microbiana usando datos de secuenciación
Este taller corto de análisis bioinformático de datos de metabarcoding está diseñado para proporcionar a los participantes las habilidades esenciales necesarias para procesar, analizar e interpretar datos de secuenciación generados a través de la técnica de metabarcoding. Los participantes explorarán los conceptos claves de metabarcoding y conocerán en las herramientas y flujos de trabajo bioinformáticos necesarios para conocer la diversidad microbiana en muestras ambientales. Asimismo, se dará a conocer metagenómica funcional y potenciales aplicaciones del metabarcoding. Requisitos previos: comprensión básica de biología molecular y bioinformática.
Introducción a métodos de fitomejoramiento participativo
Introducción a métodos y herramientas necesarios para conducir actividades en mejoramiento de semillas de variedades tradicionales cultivadas por pequeños agricultores. Principios e importancia del mejoramiento participativo y sus impactos. Métodos de selección y evaluación participativa de variedades en campo. Métodos de evaluación de la calidad de grano y/o semillas con los agricultores. Métodos de planificación participativa de actividades en un proyecto de fitomejoramiento participativo.
Actividad apoyada por ANID, Vinculación Internacional FOVI220099